巫妖双方斗了个旗鼓相当，众大巫也与众妖族捉对厮杀，双方拼死一战，最终双双破败。
众祖巫合身自爆，与东皇太一、帝俊等人同归于尽。
其中，妖师鲲鹏偷取河图、洛书，逃之夭夭。
妖神、大巫死伤无数，剩余残存者有的隐退躲藏，有的散落洪荒星辰之中迷失方向。
而在最终的大决战中，妖族的天帝帝俊和东皇太一陨落，巫族也是百不存一，当初的十二祖巫也仅剩下了后土祖巫。
而后土祖巫有感此次大战造成的罪孽太重跟天道不全，便化身为六道轮回，维持天地秩序。
许多巫族残存者退隐幽冥地府，妖族残存者退守北俱芦洲，巫妖两族自此没落。
天地受损，随着时间的推移慢慢修复，再次进入了轮回，第三纪元随着两族没落也就此结束。
第四纪元到来………
巫妖大战后人族大兴，各个天道圣人遂开派立教。
太上老君所创的人教、元始天尊所创的阐教、通天教主所创的截教兴起。
三清继承盘古大弟子名号，是为亲传弟子，各自所创的人教、阐教、截教合在一起称为盘古正宗，也称玄门，后统称道教。
接引道人与准提道人立西方教。（接引道人即为佛主“阿弥陀佛”，准提道人则为佛母“菩提祖师”），以“度化苍生”为立教宗旨。
女娲的妖教随巫妖大战泯灭（巫妖大战死伤无数，幸存的妖族中人大部分散落于洪荒星辰之中）。
巫妖大战后，东皇太一陨落，天庭无主，三清推举鸿钧身边童子（昊天）为天庭玉帝、童女（瑶池）为天庭王母。……
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