在秋叶原博士的研究所里，氛围变得异常严肃。
秋叶原博士以一种几乎庄严的语气开口：“刚才我怀疑数码世界的存在，因为我自认为没有人比我更了解网络世界，但现在……我必须承认我错了。”
科拿、小智等人全神贯注地注视着博士，期待着他的下一番话语。
秋叶原博士深吸一口气，继续说道：“在这个时代，我认为我已经掌握了网络技术的极致，但是超古代的文明呢？”
小智，是个学渣，此时听不懂，显得有些困惑：“超古代的野人？”
博士对小智的误解显得有些恼怒：“不，你理解错了。”
他转而眼神严肃地解释：“很久以前，就有人提出，在人类文明之前，存在着其他的人类文明。虽然我们缺乏直接证据，但现在……”
他的视线落在电脑屏幕上的玩具亚古兽的身上，“现在我们已经可以证实，那个超古代的文明，是存在的，其实已经超越了我们现在的时代。”
博士的声音带着一种凝重：“我曾自豪地认为，我创造的宝可梦传输系统，能够将宝可梦存入电脑中，是一个独创的杰作。”
随后，他低下了头，声音中带着一种无奈和敬畏：“但是在很久很久以前的超古代，他们已经做到了这一点，还将宝可梦装入了电脑。与此相比，还取了其他名字，那就是‘数码兽’，对，存入电脑的宝可梦，应该叫数码兽，这个名字显然更为贴切。”
科拿和其他同伴听完秋叶原博士的解释，不由得深以为然，感觉他的话大有道理。
接着，秋叶原博士继续提出他的疑惑：“但是，关于超古代的历史，到底发生了什么？所有超古代的生物都被存入了电脑，难道只是单纯为了创造一个数码世界供它们居住吗？”
这是秋叶原博士无法理解且深感忧虑的问题。
他接着想到，难道在超古代发生了某种不可告人的灾难？
而在现代，这些超古代的生物又开始从数码世界中现身，难道是那些可怕的事情已经蔓延到了数码世界，甚至波及到了现实世界？
这些超古代生物重新出现，因此导致了某些宝可梦的基因被激活，获得了所谓的返祖力量？
思考着这些问题的秋叶原博士皱紧了眉头，随即他操作设备，将玩具亚古兽从电脑中传输出来。
当玩具亚古兽出现时，博士迫不及待地上前询问：“你应该怎么称呼呢？”
“我是玩具亚古兽。”玩具亚古兽回答道。
秋叶原博士注意到，玩具亚古兽看向自己的眼神与多边兽相似，这意味着玩具亚古兽可能保留有多边兽的记忆。
他点了点头，继续关切地询问：“你有没有关于数码世界的记忆？”
玩具亚古兽摇了摇头，表明它没有相关的记忆。这让秋叶原博士感到明显的失望。
这时，科拿身旁的白海狮开口了，提供了一个可能的解释：“是因为数据还不够丰富，所以还没有完善先祖数码兽的记忆数据库。”
秋叶原博士的眼睛立刻亮了起来，转向白海狮，急切地问道：“那该如何才能增加它的数据量呢？”