灵脉之源的房间里，晶体表面的黑色纹路虽然比之前淡了许多，却仍在缓慢蔓延，能量值从5.2赫兹降至5.0赫兹。石将净化核心贴在晶体表面，金色的能量顺着晶体的纹路蔓延，黑色纹路的蔓延速度逐渐减慢，但核心的能量也在快速消耗，屏幕显示“净化核心剩余能量60%，预计还能撑3小时”。
“原生能量的残留比想象中更顽固，普通的净化方法无法彻底清除。”石的额头渗出汗水，守晶人正在用黑晶能量辅助净化，却依旧无法阻止黑色纹路的蔓延，“需要用虚空钥匙和净化核心的组合能量，才能彻底中和残留的原生能量，但钥匙还在灵枢他们手中，预计两小时后才能返回。”
周雨桐的声音从通讯器里传来：“实验室的防御系统也出现异常，脉冲炮的供能不稳定，屏障强度从8.5赫兹降至8.0赫兹，可能是原生能量的残留干扰了能量传输线路。另外，我们在实验室外围发现了守巢者的余党——是几只小型的虚空晶虫变异体，能量值6.0-7.0赫兹，正在攻击实验室的临时屏障！”
“变异体……是晶巢核心的残留能量导致晶虫变异！”石的脸色凝重，“守晶人，你们继续净化灵脉之源；我去实验室外围，围剿变异体，防止它们突破屏障！”
石带着两名守晶人赶到实验室外围，临时屏障外，五只体型比普通晶虫大3倍的变异体正疯狂撞击屏障，屏障的强度从8.0赫兹降至7.8赫兹，表面出现细小的裂缝。变异体的头部有一根小型的晶体角，能释放淡红色的能量束，击中屏障时，屏障的能量会被吞噬。
“用黑晶长矛攻击变异体的晶体角！”石握紧长矛，蓝色的能量在矛尖汇聚，矛尖的光刃暴涨至0.5米长。守晶人同时发起攻击，长矛刺向变异体的晶体角，变异体发出刺耳的嘶鸣，晶体角被刺穿，淡红色的能量从伤口涌出。
但变异体的再生能力极强，晶体角很快又重新长出来，继续攻击屏障。石意识到普通攻击无法彻底消灭变异体，他掏出通讯器：“周雨桐，将实验室的脉冲炮调整为‘黑晶能量模式’，用黑晶能量驱动脉冲炮，能彻底破坏变异体的再生能力！”
周雨桐快速操作控制台，脉冲炮的炮口泛起淡蓝色的光，能量值从4.5赫兹提升至5.0赫兹。“脉冲炮已调整完毕，随时可以发射！”
“瞄准变异体的身体！”石大喊，脉冲炮同时发射，淡蓝色的能量束射向变异体的身体。能量束击中变异体，变异体的身体泛起涟漪，再生能力被抑制，晶体角不再生长。石趁机冲过去，长矛刺向变异体的核心，变异体发出惨叫，身体逐渐化为黑色粉末。
五只变异体被陆续消灭，实验室的临时屏障暂时安全。但通讯器里突然传来灵枢的声音：“石！我们在返回的途中遭遇了守晶者的余党——是三只体型更大的变异体，能量值8.0-8.5赫兹，它们正在攻击我们的直升机，直升机的螺旋桨被击中，我们被迫降落在虚空边缘的废弃基地！”
“废弃基地……是之前孙博文的余党藏身的地方，那里有大量的灵脉能量残留，变异体可能是被能量吸引过去的！”石的脸色凝重，“我立刻带守晶人过去支援，你们尽量拖延时间，用黑晶碎片和虚空钥匙的能量暂时压制变异体！”
石带着三名守晶人通过虚空通道抵达废弃基地，基地的地面布满了废弃的能量武器和晶体碎片，灵枢、赵曦、林辰正躲在一座废弃的仓库里，仓库的大门被变异体撞击得摇摇欲坠，能量值显示8.3赫兹。
“我们来了！”石大喊，守晶人同时展开黑晶屏障，将仓库包围。变异体发现了他们，转身冲向石，晶体角释放出淡红色的能量束。石展开双生能量盾（他在战斗中学会了简单的双生能量运用），能量束击中盾面，盾面泛起涟漪，强度从8.0赫兹降至7.5赫兹。
灵枢和赵曦趁机从仓库里冲出，双生能量在两人之间形成一道“金蓝混合光箭”，射向变异体的核心。光箭击中变异体，黑色的血液喷涌而出，变异体的动作变得迟缓。石和守晶人趁机用长矛刺向变异体的晶体角，变异体发出惨叫，身体逐渐透明。
战斗持续了半小时，三只变异体被全部消灭。林辰的手臂伤口因为剧烈运动，再次流血，能量值降至4.6赫兹，需要立刻返回实验室治疗。灵脉之源的能量值已降至4.8赫兹，黑色纹路的蔓延速度加快，净化核心的剩余能量只有40%，情况危急。
众人快速返回实验室，赵曦立刻将虚空钥匙贴在灵脉之源的晶体上，钥匙的淡蓝光与净化核心的金色光融合，形成一道“双能量净化场”。黑色纹路在净化场的作用下逐渐消退，晶体的能量值从4.8赫兹回升至5.0赫兹，最终稳定在5.3赫兹。
“终于稳定了……”石松了一口气，守晶人也累得瘫坐在地上，能量值均降至4.0赫兹左右。但通讯器里突然传来周雨桐的警报：“实验室的雷达检测到大量未知飞行物正在向新海市靠近，数量超过100只，能量值7.0-8.0赫兹，疑似守巢者的其他余党！”
灵枢走到控制台前，调出雷达的实时画面，屏幕上的红点密密麻麻，正以每分钟10公里的速度向新海市靠近：“是之前逃脱的虚空晶虫变异体，它们聚集在一起，形成了一个小型的虫群，目标应该是灵脉之源！”
“启动实验室的所有防御！脉冲炮调整为黑晶能量模式，屏障强度提升至8.5赫兹！”赵曦下令，周雨桐快速操作控制台，实验室的外围响起脉冲炮的轰鸣声，屏障的淡蓝色光变得更亮。
虫群靠近实验室时，脉冲炮同时发射，淡蓝色的能量束如暴雨般射向虫群。变异体被能量束击中，纷纷化为黑色粉末，但后续的变异体源源不断地冲上来，屏障的强度从8.5赫兹降至8.2赫兹，表面的裂缝逐渐扩大。
“用虚空钥匙和净化核心的能量构建终极防御！”灵枢大喊，赵曦将钥匙和核心放在控制台的能量接口上，两道能量融合，形成一道金色的能量波，席卷整个实验室外围。虫群被能量波击中，瞬间化为粉末，实验室的危机暂时解除。
但雷达屏幕上，一道深红色的能量轨迹再次出现，能量值升至11.0赫兹，比之前的原生虚空能量更强，正在向新海市快速靠近——是虚空晶巢的“母巢能量”，守巢者的真正源头！