为了前往绿岭岛，而在多个小岛之间转搭的小智一行人，今天继续着旅行，而今天他们则是选择了租船自驾，“今天天气很好啊，果然是出海的好时机。”小遥对于这种旅行非常的惬意。
“是啊，真的很不错呢。”小智也难得的进行着日光浴。
“你们看。”不过事情果然不会像小智他们所预期的那样一帆风顺，小胜这时指着远方的海面提醒大家。
“是巨牙鲨。”掌舵的小刚这时也发现了原来是一个背鳍，而通过背鳍就可以猜出来是一只巨牙鲨。
“是当初前往武斗岛的时候挡路的那只巨牙鲨的头领。”小智这时也看到了这只比一般巨牙鲨体型大三倍，而且背鳍上有一个“×”形疤痕的巨牙鲨。
“它怎么跑到这里啦，又来撞我们的船了。”小遥有点惊慌，毕竟鲨鱼还是很恐怖的。
“既然这样，皮卡丘，十万伏特。”小智只好选择攻击了，当初巴大蝶赶跑了一群巨牙鲨，现在没有小弟的头头，小智当然也不惧，皮卡丘跳到船头，“piiika-chuuuuuuuu。”一发黄色电流准确命中，巨牙鲨直接就翻肚白了，“去吧，精灵球。”随后小智丢出精灵球收服了这只巨牙鲨，传回了波克基斯。
“不好，你们看那边。”不过就在此时，小刚突然指着远方喊了起来。
“为什么会有这么多旋涡。”原来是远方的海面突然多了许多的旋涡，而且正在向着这边蔓延，小胜慌乱了起来。
“看来巨牙鲨是因为一直逃避，所以才体力透支的。”小智也明白了怪不得大巨牙鲨中了一发十万伏特就不行了，“丑丑鱼，守住。”看着旋涡已经逼近了，小智只好让丑丑鱼使用守住包住整个船，然后小船就被旋涡带着向着不知道什么地方快速飘去。
…………
“终于平安登陆了。”还好路上没有出现什么差错，几人平安的登上了一个不知名小岛，小遥踩上地面后还心有余悸。
“嘘。”不过小智这时发现了什么。
“那不是海洋队吗？”几人躲到一处灌木丛后面，小刚就看到了身穿海魂衫衣服，上面标有骷髅头的海洋队。
“还有熔岩队。”小胜也看到了海洋队对面身穿红色条纹衣服，标有火山的熔岩队。
“他们两队不是死对头吗？怎么感觉像是达成了某种协议。”小遥这时看着两方头领同时登上一个类似祭台的建筑，有点疑惑。
“不好。”看到赤焰松摘下眼睛，水梧桐也把胸前挂的船锚饰品取了下来，分别放在了祭台的两侧凸起的石柱上，小智就知道要出大事了，果然随后就是两根石柱和他们的饰品发生了反应，然后祭台中间升起一块巨石，巨石如水晶般璀璨，熠熠生辉。
“那个是什么啊，好漂亮啊。”小遥则是沉醉于巨石的光芒中。
“那个应该是传说的巨石，根据古老的传说流传至今的残旧古文书记载，这块巨石可能是ga进化的根源。”小智只好做出解释，不过现在可能要出大事了，他没想到赤焰松和水梧桐都有ga进化的钥石，而且会达成协议一起合作。
“哈哈哈，这块巨石是我的了，而且要用原始回归的盖欧卡的力量来增大海洋面积，来建立宝可梦的理想家乡。”水梧桐这时也让部下放出了之前捕获的盖欧卡，盖欧卡一到海里就因为靛蓝色宝珠而发生了原始回归，然后原始回归盖欧卡的特性始源之海发动，立刻下起了大雨。
“才不会让你如愿，我要增大陆地面积来追求人类的理想世界，去吧，固拉多。”赤焰松也放出了之前捕获的固拉多，想要抢夺巨石的能量，固拉多一出场也是因为朱红色宝珠而原始回归，它的特性终结之地冲破了大雨天气，天气转为大日照。
“我好像记得有一个传说。”小胜看着正在向着这边冲来的两只宝可梦，有点不确定的说，“在超古代世界中，创造了陆地的原始固拉多和创造了海洋的原始盖欧卡，据说这两只宝可梦会为了追求某种强大的能量而持续争斗，这场争斗惊天动地，使得世界面临毁灭的危机。不会这两只宝可梦追求的能量就是这块巨石吧。”看着好像并没有按照水梧桐、赤焰松预想的样子进行的两只宝可梦，小胜最后猜测。
“怎么会这样，盖欧卡。”
“固拉多。”这时，水梧桐和赤焰松也发现了情况不对，原始盖欧卡和原始固拉多并没有管他们两个，直接就朝着巨石而去，并且两只宝可梦打了起来，原始盖欧卡一个绝对零度，就把周围的海洋冰封了起来，并且把原始固拉多也冻了起来，不过原始固拉多靠着温度融化了冰层，随后反击了一发断崖之剑，水下冲出石柱顶飞了原始盖欧卡。
“怎么会这样。”看着什么都不顾而不断破坏的两只宝可梦，赤焰松和水梧桐的仿佛失去了信仰，这不是他们想要的，他们是想有一个理想的世界，但是却用错了方式。
“你们还不懂吗？世界的存在是有其自然规律的，你们的介入只会让它走向毁灭。”小智这个时候没办法了，如果真这样下去，可能世界真的要完蛋了。
“他说的没错，你们需要重新去思考一下你们做了这么久到底是为了什么，而现在到底又是造成了什么。”
“大吾先生。”没错来的正是大吾，小遥看到后非常开心，毕竟当初大吾也帮过他们，相信是和他们一派的。
“现在必须要阻止他们了，拉帝欧斯。”小智派出了拉帝欧斯。
“巨金怪。”大吾先生的宝可梦是一只银色的异色巨金怪。
“喷火驼，你也出来帮忙。”