某个阳光明媚的上午，小智三人终于抵达了百代市，百代市是将过去联系到今日的城镇。
小智也没有着急去百代道馆挑战，而是先是去了一趟宝可梦中心。
然后三人围着百代市转了一圈，在百代市的东边，看到了伫立在那里的两个大大的雕像，就是帝牙卢卡和帕路奇亚，掌管时空的二神。
接着去往百代历史博物馆参观了一番，见到了收藏在那里的金刚宝珠，而且小智也看到了“时空之塔”的模型。
值得一提的是，他们在博物馆碰到了尚志先生，原来尚志先生昨天挑战了百代道馆得到了徽章，现在则是来博物馆丰富历史文化知识，提高个人素养，尚志先生目前有一个徽章和一个缎带。
尚志先生也向小智他们讲述了神奥地区的创世传说。最初始所存在的只有混沌与波动而已，一切混杂在一起，由中心诞生出了最初之物，最初之物创造了两分身，时间开始转动运行，空间开始扩张延伸，其后，又由自己身上诞生出三条生命，两个分身一祈祷，诞生了称为物之物，三条生命一祈祷，诞生了称为心之物，因为世界被创造出来，所以最初之物便就此沉眠。
小智知道那个最初之物是阿尔宙斯，两分身就是帝牙卢卡和帕路奇亚，三条生命则是湖之众神三圣菇，不过小光和小刚听后一头雾水，不太懂，小智也没有多做解释，有些事情还是越少人知道越好。
中午，大家回到宝可梦中心吃过午饭后，稍微休息了一会儿，然后小智就带着小光和小刚来到了百代道馆。
走进百代道馆后，就有一位带着眼镜，身穿紫色运动衣的大姐姐接待了小智他们，她旁边跟着一只长鼻叶，应该就是之前在百代森林给菜种递消息的长鼻叶。
“哇，百代道馆里面种满了树木和草啊。”一路直接来到了对战场地，小光就看到对战场地几乎是被绿色圈起来的了，而且上面顶棚也是开着的，阳光铺洒下来，和之前的岩石道馆光秃秃的场地形成非常鲜明的对比。
“不愧是草系宝可梦的道馆啊，的确是非常优良的地方。”小刚点评说。
“小智，欢迎来到百代道馆。”菜种也从旁走了出来，和小智打招呼，“今天是适合道馆战的天气，来进行一场大家都不后悔的战斗吧。”
“好的。”
“现在开始进行挑战者真新镇的小智和道馆训练家菜种的道馆比赛，使用的宝可梦是三只，当有一方的三只宝可梦全部失去战斗能力的时候，比赛即为结束，比赛中只有挑战者可以交换宝可梦，比赛开始。”话不多说，双方站好对战位后，裁判宣布比赛开始了。
“去吧，樱花宝。”
“哇，好可爱啊。”看到菜种派出的樱花宝，在观战席为小智加油的小光开心的说道，的确小光是比较偏爱可爱类型宝可梦的人，樱花宝和波加曼、卷卷耳、帕奇利兹完全可以说是同一种小巧可爱类型的宝可梦了。
“雨翅蛾，决定是你了。”小智派出了雨翅蛾，是他上午在宝可梦中心临时交换来参战的，雨翅蛾一出场就发动了威吓特性。
“樱花宝，大晴天。”
“触发叶绿素吗，雨翅蛾，黏黏网。”
樱花宝头顶上的绿色叶片发出几条光线曲折着打向空中，天气变为了大晴天，樱花宝的特性叶绿素发动，速度翻倍；雨翅蛾嘴中吐出几张黄绿色的网子，打到了樱花宝的四周，而后网子隐于四周，对樱花宝没有任何作用。
“樱花宝，日光束。”
“避开，冰冻之风。”
雨翅蛾之前传回大木博士研究所可不是去享福的，它是去向其他宝可梦学习的，小智的可以飞的宝可梦都是可以完美避开这种直线条的攻击的，小光都可以让波加曼旋转来闪避，更别说小智这个利用风压和气流的大师了。
雨翅蛾乘着日光束打来所带起的高强气流飞上空中，反身就是大片蓝色寒气风暴，樱花宝身上有些许冰霜，速度被降低了，效果拔群。
“雨翅蛾，空气斩。”
“樱花宝，避开，魔法叶。”
雨翅蛾上空快速聚集一颗风暴能量，打出途中变为一片刀刃，不过虽然樱花宝速度被减了一级，但是叶绿素的翻倍还是生效的，樱花宝直接就闪了过去，必中的魔法叶也打中了雨翅蛾，不过，雨翅蛾对草系技能四倍抵抗。
“冰冻之风。”看到空气斩无法命中，雨翅蛾再次发出冰冻之风，大面积的寒风，樱花宝无处可躲，效果拔群，速度再次被减，叶绿素的速度加成已经被冰冻之风完全抹掉了。
“樱花宝，再一次魔法叶。”
“空气斩。”
面对泛着绿光的叶片，可以划破天空的空气刀刃直接全部切断，随后打中了后面的樱花宝，效果拔群。
“樱花宝失去战斗能力，雨翅蛾获胜。”
“樱花宝，辛苦了；干的不错，小智。”菜种收回了樱花宝，“上吧，草苗龟。”之前见过的草苗龟上场，不过草苗龟一上场，四周就出现了黏黏网粘在草苗龟身上，草苗龟速度被减。
“菜种小姐的宝可梦速度都不是一般的快，所以我特地让雨翅蛾使用了黏黏网，雨翅蛾回来吧，姆克鸟，就决定是你了。”同时小智也换棒姆克鸟出场，姆克鸟同样是威吓特性，草苗龟攻击被减。
“草苗龟，寄生种子。”
“影子分身，燕返。”
草苗龟头顶上的枝条发出一颗种子，姆克鸟则是迅速分出许多的分身，种子从一个身影穿了过去，只是落到了地上，而后姆克鸟带着分身一起冲向了草苗龟，直接命中，把草苗龟撞飞了出去，效果拔群。