持续着旅行的小智一行人，今天依旧由小刚看着地图带路，不过此时他们前面是一个大大的湖泊，湖泊中央立着一座小山，上面一座古朴的小镇，有一座桥通往外面。
“诶？小刚你最近的带路水平下降了好多啊。”小光看着眼前的湖泊有点绝望，他们要怎么到对面去啊。
小智也是扶额，前几天，他们刚迷路了一番，不过碰到了梦妖魔，今天小刚又是带错了路，本来想去城镇休息补给的。
“好像走到相反方向了。”小刚抱歉的说。
“觉得好累啊。”连番的露宿，小光非常的疲惫。
“皮卡~。”皮卡丘也有点无奈。
“要不要坐上来。”不过此时，突然传来这样的声音，但是小智他们环顾四周并没有看到有任何人。
“皮卡~。”还是皮神的雷达比较灵敏，发现是在空中。
大家抬头就看到一个绿色的热气球慢慢的落了下来，热气球上有一位小刚喜欢的大姐姐，金色的披肩卷发，红色的衣服，还有一只小火焰猴在用喷射火焰控制热气球的升降。
大家乘上了热气球，然后向小镇飘去，并且互相做了自我介绍。
大姐姐的名字叫做艾莉丝，艾莉丝平时是学习音乐的，偶尔乘坐热气球来当导游，艾莉丝还用叶片为大家吹奏了一曲，小智他们前方的城镇是白杨镇。
小刚当然是展开了攻势，但是被不良蛙拖走了，小光看到一旁飘着一只拿着收发器的随风球，领略着下方清澈如翡翠的湖泊，她对这里充满了兴趣。
而小智则是望向城镇，看到了远方高高耸立的时空之塔，刚刚艾莉丝吹草笛所吹奏的音乐正是奥拉席翁。
“哇，好大的建筑。”热气球飘到白杨镇上空后，小光看着时空之塔惊叹道，时空之塔由两个高塔所组成。
艾莉丝为大家做了介绍，时空之塔是天才建筑师高第年前所设计建造的，右边是象征时间的时之塔，左边是象征空间的空之塔，而且时空之塔是这个世界上最大的乐器。。
“皮？皮卡~。”皮卡丘好像突然感应到了什么，耳朵轻微的晃动，然后一股不知道什么的能量引起的风暴对热气球造成了影响，小智他们紧紧抓着热气球，防止掉落下去，还好这个能量风暴来的快去的也快，大家都平安无事。
热气球停到小镇后，艾莉丝就当导游带着小智他们在城镇中游览，城镇中到处都有训练家在对战，小智几人买了棉花糖，开心的跟着艾莉丝走在小镇的街道，古朴的气息非常的怡人。
来到一处广场，小智他们碰到了三位训练家两男一女，蓝衣大叔苔哥、白西服小哥胜海和红发少女小薪。
三位训练家对小智他们发起了挑战。
苔哥的宝可梦是一只帝王拿波，波加曼的最终进化型，小光使用波加曼和它对战，虽然波加曼非常的努力，但是实力的硬差距，最后败下阵来。
小刚使用不良蛙和小薪的烈焰猴近身格斗，打的有来有回，最后大家握手言和。
最后是小智的对手，胜海，他使用的宝可梦是一只土台龟。
“泳圈鼬，决定是你了。”小智派出的宝可梦是水系的泳圈鼬。
“bibi~。”泳圈鼬一出场就是表现了很强的战斗欲，而且对手是草地的土台龟，属性方面相性很不错，而且泳圈鼬自从跟了小智后，虽然它之前都是自己训练，非常的刻苦，但是有了小智的系统性训练指导，更加的如虎添翼，实力呈指数般增长，马上就要迎来瓶颈期了，不过它离进化也不远了，到时候进化突破瓶颈，会再次进入实力剧增阶段。
“求雨。”小智也不废话，直接就让泳圈鼬使用求雨，天气变为了下雨，泳圈鼬悠游自如特性发动，水系威力增强，而对于喜欢阳光可以使用日光束的土台龟来说非常的不爽。
接下来的战斗可以说是一边倒，土台龟使用种子炸弹，泳圈鼬直接水流喷射先制冲了过去，对土台龟造成一倍伤害，种子炸弹也被泳圈鼬利用高速闪避了过去。
接下来土台龟用出种子机关枪，和种子炸弹一样被躲避掉，而泳圈鼬并没有远离土台龟，一发冰冻拳，四倍伤。
胜海赌到日光束这个技能，但是蓄力阶段，泳圈鼬就是再一次冰冻拳，四倍伤，土台龟直接下场了，没有任何反击的机会。
告别了三人后，艾莉丝带着小智他们来到了白杨镇的庭院，这里是艾莉丝最喜欢的地方，而这个庭院同样是高第设计建造的，是以“自然、人类和宝可梦和谐相处”为主题设计的。
庭院中鲜花与绿植遍布，喷泉与水池点缀，各种宝可梦在开心的嬉戏，而艾莉丝从小就在这里玩，所以和这里的宝可梦们都是朋友。
小智、小光和小刚也把自己的宝可梦都派了出来，大家高兴的在庭院中奔跑玩闹。
小智他们一路来到了庭院的尽头，这里可以看到包围着城镇的湖泊，宝可梦们在一处空旷的地方玩乐。
不过好景不长，不知为何宝可梦们打了起来，一边是以波加曼为首的小光的宝可梦，一边是庭院中的野生宝可梦。
皮卡丘在一旁劝架，但是毫无用处。
“不可以打架啊。”小光看到后，立刻跑了过去，这一路上她也是遇到过很多次这种情况了，她的波加曼太能闹腾了，而且还特别不服输，所以就很容易出事情，不过这也是波加曼的性格，不然当初也许就不会和小光相遇了，这是他们的缘分。
艾莉丝这个时候拿出一片叶片，再次吹起草笛，是刚刚听过的曲子，宝可梦们听到音乐后，慢慢的平复了下来，心中的暴戾之气都消失了。
随着艾莉丝的演奏，庭院中的宝可梦们越来越多的聚集过来，大家都非常的享受。
小智也觉得自己的内心更加空旷宁静下来。
皮卡丘跑到一旁的树上，摘下两颗桃桃果，递给了波加曼和一只小猫怪，看来之前应该是为了争夺一颗树果而闹得不愉快，不过现在大家都相安无事了。
“真的很美.妙。”艾莉丝吹完后，小光赞叹的说。
“是从奶奶那里学会的。”
“那个，艾莉丝，我可以要一份这个音乐的谱子吗？”小智这个时候提出了请求，他真的非常的喜欢这首音乐，小智之前是有学过乐器的，主修的竹笛，不过水平一般，后来又去学了一下西洋乐器钢琴和小提琴，同样没有那么精通，小智还会吹口琴，这个单纯就是自娱自乐，所以小智的乐器方面也就是样样稀松状态，不过在这个世界，还是稍微能看的。
“诶？”小光非常的诧异，她没有见过小智路上演奏过乐器或者吹过草笛。
小智找了一片叶片，尝试着吹了一下，成功了吹出了前两句。
“可以，我现在默一份给你。”艾莉丝也没有藏着掖着，听了小智吹的那两句后，在石凳上接过小智递过来的纸笔，给小智默写了一份，这个旋律早已深入她的心中了。
“没想到，小智还会乐器。”小光则是又发现了小智的一个闪光点。
就在小智郑重地把艾莉丝递过来的曲谱保存好后，一只艾路雷朵跳了过来，对着艾莉丝叫着，随后跳了出去，好像是那边发生了什么事情，大家把各自的宝可梦收回去后，就向前追去。
来到庭院的某处，就看到两根石柱不知道怎么被毁坏了，倒在地上。
“好过分啊，这是谁干的。”
“是达克莱伊。”艾莉丝话音刚落，就有一个声音回答了她，一旁绿色植被覆盖的走廊里走出一个身穿红色男爵服装红色短发的成年男性。
“艾伯特。”艾莉丝是认识这个人的，他是艾伯特男爵。
“最近听说有人在街道上目击到它。”艾伯特男爵一边走过来一边说道，“就是它干的好事。”
“达克莱伊？”小光对达克莱伊不是很了解。
“达克莱伊是恶属性的宝可梦，为了保护自己，它会诱使人或宝可梦进入深度睡眠状态，而它的特性是梦魇，会使进入睡眠的人或宝可梦做噩梦，所以又被称为噩梦神，但是它其实是没有恶意的。”小智解释一下，达克莱伊虽然是噩梦神，但是它真的毫无恶意，特别是在这里的这只达克莱伊可以说是天使般的存在。
“我才不信。”不过小智的话并没有打消艾伯特男爵对达克莱伊的成见。
就在这时旁边不远处的草丛晃动了起来。
“谁在那里？”艾莉丝立刻问道。
“是达克莱伊吗？大舌舔，破坏光线。”艾伯特男爵一言不合直接派出大舌舔来攻击。
“啊——。”不过摇晃的草丛没有出现差不多娃娃，而是一个男青年被炸了出来，他手上抱着一个电脑，“为什么这么突然。”一只拿着收发器的随风球慢慢地停在了他旁边，这只随风球正是之前小智他们乘热气球，旁边飘着的那只，看来是这个人的宝可梦。
“东尼欧。”艾莉丝认出了那个人，担心的跑了过去。
随后东尼欧电脑连接上随风球的收发器，上面在不断处理着数据。
艾莉丝也向小智他们介绍了东尼欧，东尼欧是一位科学家，而他正在调查最近白杨镇出现空间异常的原因。
不过艾伯特男爵看到东尼欧出现后，艾莉丝就一直围着东尼欧转，就让她不用对东尼欧这么好，并且说艾莉丝是她未来的妻子，原来艾伯特男爵喜欢艾莉丝。不过艾莉丝则是表示她早已拒绝过男爵了，她现在还没有结婚的打算，而且她喜欢的人是东尼欧，但是东尼欧是性格比较弱的人，不太敢明面上直接接受艾莉丝的心意，也可以称他为闷骚。
“皮卡~。”皮卡丘又是仿佛感应到了什么。
随后之前遇到过的能量风暴再次袭来，东尼欧电脑上的数据和三维图也在不断的波动，“这个现象到底是怎么回事？”东尼欧看着电脑一头雾水。
“你们看那边。”随着小光的喊声，大家就看到又一根石柱突然断了，断面有紫红色的能量闪过。
一道黑色的影子在小智他们脚下转了几圈，一只黑色的宝可梦慢慢从影子中升了上来，“不要到这里来。”这只宝可梦就是达克莱伊，达克莱伊通过心灵感应说着。
“果然是你吗，达克莱伊。”艾伯特男爵看到达克莱伊后非常的激动，“上吧，大舌舔。”大舌舔打出破坏光线，但是达克莱伊直接化身影子，闪过了攻击，在地面快速飘动，重新来到地面后，打出一颗黑色的球体，是达克莱伊的特有技能暗黑洞，可以将对手强制拖入黑暗世界，让其陷入睡眠状态。
大舌舔虽然体型看起来比较笨拙，但却是一个灵活的胖子，一个闪身，避开了暗黑洞，暗黑洞打中了后面的小智，当然了，其实小智是有意要被打中的，因为他知道这里发生的情况，但是他需要一个契机来告诉大家，而达克莱伊的暗黑洞就是这个契机。
暗黑洞的黑色球体包住了小智，小智进入了睡眠状态，不过小智并没有因为达克莱伊的梦魇特性而做噩梦，小智来到了色彩消失的庭院，达克莱伊在他对面，而后达克莱伊化为黑影，一个虚无的影像在黑影中挣扎，仿佛想要冲出来，小智知道这是受伤的帕路奇亚。
因为阿尔宙斯即将苏醒，使得帝牙卢卡和帕路奇亚所处的空间发生了碰撞，双方都以为是对方侵犯了自己的领土，所以打斗了起来，在战斗中帕路奇亚被打伤了，为了躲避帝牙卢卡的追击，它来到了这里，而达克莱伊为了保护这个小镇所以不让帕路奇亚来到这里。
“小智，你醒醒。”
“这里是。”小智在小光的呼喊下，慢慢的苏醒过来，醒来后，小智发现自己躺在g上。
“皮卡皮~。”
“这里是宝可梦中心。”小刚在一旁说道。
“我在梦里看到了影像，是帕路奇亚的身影，达克莱伊的那句不要来这里是对它说的。”小智直接就说出造成空间波动和达克莱伊出没的原因。
“原来达克莱伊是为了保护这个城镇。”艾莉丝说道。
“其实，艾莉丝，小时候那次我们在庭院玩，你不小心从悬崖坠下，是达克莱伊救了你，所以我也相信达克莱伊是为了保护这个城镇。”东尼欧这时说道。
“东尼欧。”也许是因为这个误会使得艾莉丝对东尼欧产生了好感，但是后续的感情培养却是两个人共同，艾莉丝并不是为了当初的一个误会就这么多年来一直喜欢东尼欧的。
“帕路奇亚？等一等，这需要更进一步的研究，我记得高第的日记好像有记载。”东尼欧想到小智刚刚提到的帕路奇亚，记得自己好像曾经看过这个词。
东尼欧直接就向外跑去。
“艾莉丝小姐，应该是知道东尼欧去哪里了吧，可以带我们去吗？”小智从g上下来后，对艾莉丝说道。
“嗯。”
然后就在艾莉丝的带领下，大家来到了时空之塔前，路上也从艾莉丝那里得知高第是东尼欧的曾祖父，刚走到时空之塔，时空之塔就响起了音乐，声音传遍整个小镇，大家欢快的跳着。
“这里就是时空之塔的内部啊。”走进时空之塔，有一些彩色玻璃，地面也是多色的琉璃砖所铺成，小光惊叹道。
时之塔里有巨大的摆锤，空之塔里有绕行的球体，两座塔外之间是长细的螺旋梯，通往塔的顶部。
艾莉丝也介绍了这个时空之塔塔顶有大机器，如果把特殊的圆盘放在占位中和拉了机器的杠杆就能奏乐。乐器的功用跟钢琴相似，但钢丝弦在圆柱里排列。
大家在一旁也看到了一处比赛会场，艾莉丝说是用于华丽大赛的，而且刚好明天就会举办一场，小光立刻表示要参加。
走到时空之塔最中心，映入大家眼帘的是一幅巨大的浮雕壁画，一棵郁葱的大树，一位女孩坐在树枝上吹着草笛，旁边是各种宝可梦围绕，非常和谐的画面。
“东尼欧就在时空之塔的地下室了。”
大家一起来到地下室后，就仿佛走进了图书馆一般，而且还有许多的电脑一起在检测运行着，而东尼欧在翻着抽屉。
“找到了。”在一个抽屉深处，东尼欧找到了一本绿色的旧旧的本子，“这个就是高第的日记了。”
大家一起坐了下来，东尼欧打开了高第的日记。
高第的日记前面是一些很常规的个人记录，但是突然一张照片掉落出来，上面是一个老爷爷和一个女孩。
“艾莉西亚在庭院碰到了达克莱伊，被所有人讨厌的达克莱伊对艾莉西亚敞开了心扉。”日记上也有记载，原来是达克莱伊受伤来到庭院，但是被所有宝可梦讨厌，达克莱伊为了保护自己对宝可梦们发起了攻击，是艾莉西亚让大家平复的，而达克莱伊也从此留了下来。
“是我奶奶。”听到“艾莉西亚”这个名字，艾莉丝也知道了原来这个女孩就是自己的奶奶。
“那这个老爷爷就是高第了。”小刚猜测说。
“对了，刚刚看的那个壁画上的小女孩好像就是艾莉丝的奶奶艾莉西亚。”小光也是想起了刚刚才看过的壁画。
艾莉丝小姐把照片反过来后到了后面有谱子，还有一个特别的符号，不过艾莉丝小姐也没有提出什么，因为她认识那个曲谱就是“奥拉席翁”，她铭记于心的谱子，不过照片归艾莉丝小姐了。
随后东尼欧继续翻着，这次是翻到了时空之塔的设计图，旁边还有两行字。