敲定赔款事宜，双方紧接着便商榷驻军管理、皇权权限以及遣散部队等诸项事宜。朱朗提出，大明需在倭岛沿海三处要地驻军，负责海防安全与物资押运，驻军所需粮草由倭国供给，但驻军不得干涉倭国内部民生政务。
谈及皇权权限，朱朗明确划定，良仁继位后可执掌祭祀、民生等日常事务，但涉及外交、军事等重大决策，必须与大明派驻的亲王商议后方能施行。至于遣散部队条款，则要求倭国在半年内遣散幕府私兵与各藩多余武士，只保留少量维护治安的常备人员，遣散所需的安置费用，由倭国自行承担。
朱朗还提出，皇室必须交出所有幕府残余战犯与残匪，若良仁不便出面处置，便由大明军队出兵清缴，所有战俘归大明处置，绝非简单安置。
这些条款对于倭国皇室来说，本就是微不足道的东西。他们早就被幕府剥夺得一干二净，兵权旁落，财库空空，从前被幕府像养猪一样圈养在深宫，别说掌控国家大事，就连日常起居的小事都要一一报备幕府，那种屈辱与憋闷，早已刻进了骨子里。如今不过是将这些本就不属于自己的东西转手交给大明，便能换来未来部分皇权的实掌，在良仁看来，这实在是桩再实惠不过的买卖。
他满心欢喜地应下所有条款，却浑然不知，自己此刻签下的每一个字，都是一个精心编织的大圈套。这个圈套会在几十年后，让他陷入无尽的悔恨之中，终其一生都无法挣脱。
而帐内列席的鲁王、唐王两位藩王，看着这场议和的全过程，亦是收获颇丰。他们并非什么也没得到，相反，此次随军出征，他们实实在在收获了大量作战经验和管理经验。如何统筹管理军队，如何制定战争策略，如何进行战场指挥，他们都看在眼里记在心里。这些都是极为宝贵的经验，若是没有这场战争，他们永远不会有机会学到。尤其是这场降维打击的战事，用现代化热武器碾压冷兵器时代的敌国，绝非一味冲杀便能取胜，其中需要的策略布局，以及如何利用作战技巧以最小代价赢得胜利，都让两位藩王大开眼界。
很快，幕府残余力量陆续交出武器，向大明投降，倭国战犯尽数被押送至指定地点，交由大明处置。
包括良仁在内的倭国皇室与贵族，不再是单人独行，而是一伙一伙一群一群地前往京都郊外新建的神庙朝拜。为了增加神秘感，朱朗下令让战犯奴隶快速搭建起这所神庙，神庙之下，正是被精心遮挡伪装的时光门。朱朗定下规矩，进入神庙朝拜之人，若能得到神殿“宽恕”，便可顺利走出，既往不咎；若身负重罪被“神罚”，便只能自认倒霉，怨不得旁人。
议和的最后一项议程，便是商榷国名与君主称谓。朱朗看着条款草案，冷笑一声，掷在良仁面前：“一个弹丸小国，竟敢僭越使用天皇称谓，简直胆大妄为。从今日起，废除天皇名号，国名定为本州岛帝国。”
良仁不敢有半句异议，只能俯首称是。最终，朱朗正式下诏，立良仁为本州岛帝国的第一位国王，赐小名庶皇帝，受大明节制，世代向大明称臣纳贡。
唐王朱聿键和鲁王朱以海，以及朝鲜王李淏，齐齐向朱朗行拜师之礼，尊朱朗为师。朱朗坦然受了三人的礼，将此前李淏奉上的一万担粮食，算作了他的拜师礼，也是他此番随军观战学习战争知识的酬谢。